Passende ventilationsystemer i en kyllingeskur er nødvendige for at holde ammoniak, kulioxid, stille luft og fugtig luft væk og vedligeholde en sund indre miljø. Ventilation hjælper med at fjerne affald og kontrollere temperatur og fugtighed indenfor skuret. De forskellige typer af ventilation inkluderer naturlig ventilation, der bruger vinduer og luftning, og mekanisk ventilation, der bruger fans. Forhindring af luftkontaminering, samtidig med at garantere mod bakteriel infestation og nedbringe chancen for respiratoriske infektioner, gøres muligt af et velplanlagt kyllingeskurventilationsystem.